MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Francisella noatunensis subsp. orientalis str. Toba 04 chromosome

Total Repeats: 32892

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3502	NC_017909	A	6	6	200131	200136	100 %	0 %	0 %	0 %	387885942
3503	NC_017909	TGC	2	6	200175	200180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387885942
3504	NC_017909	AGAC	2	8	200216	200223	50 %	0 %	25 %	25 %	387885942
3505	NC_017909	TTG	2	6	200225	200230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387885942
3506	NC_017909	AAG	2	6	200248	200253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387885942
3507	NC_017909	AAG	2	6	200261	200266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387885942
3508	NC_017909	AGC	2	6	200274	200279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387885942
3509	NC_017909	GCA	2	6	200284	200289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387885942
3510	NC_017909	GAA	2	6	200305	200310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387885942
3511	NC_017909	GCT	2	6	200317	200322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387885942
3512	NC_017909	GAA	2	6	200347	200352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387885942
3513	NC_017909	TGG	2	6	200445	200450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387885942
3514	NC_017909	GTT	2	6	200461	200466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387885942
3515	NC_017909	GCT	2	6	200467	200472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387885942
3516	NC_017909	AGC	2	6	200520	200525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387885942
3517	NC_017909	TGA	2	6	200550	200555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387885942
3518	NC_017909	CTG	2	6	200561	200566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387885942
3519	NC_017909	AGAA	2	8	200582	200589	75 %	0 %	25 %	0 %	387885942
3520	NC_017909	AAAG	2	8	200608	200615	75 %	0 %	25 %	0 %	387885942
3521	NC_017909	CTG	2	6	200624	200629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387885942
3522	NC_017909	ATT	2	6	200632	200637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387885942
3523	NC_017909	TTG	2	6	200648	200653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387885942
3524	NC_017909	AGT	2	6	200757	200762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387885942
3525	NC_017909	GAA	2	6	200799	200804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387885942
3526	NC_017909	AGA	3	9	200805	200813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387885942
3527	NC_017909	GCA	2	6	200818	200823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387885942
3528	NC_017909	TGA	2	6	200828	200833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387885942
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3530	NC_017909	AG	3	6	200900	200905	50 %	0 %	50 %	0 %	387885943
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3532	NC_017909	TTAAG	2	10	200912	200921	40 %	40 %	20 %	0 %	387885943
3533	NC_017909	CTG	2	6	200969	200974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387885943
3534	NC_017909	AAATC	2	10	200985	200994	60 %	20 %	0 %	20 %	387885943
3535	NC_017909	TGG	3	9	201036	201044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387885943
3536	NC_017909	GGC	2	6	201058	201063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387885943
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3538	NC_017909	CTA	2	6	201122	201127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387885943
3539	NC_017909	TTA	2	6	201158	201163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387885943
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3541	NC_017909	TAC	2	6	201312	201317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387885943
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3543	NC_017909	AAAT	2	8	201399	201406	75 %	25 %	0 %	0 %	387885943
3544	NC_017909	GGT	2	6	201447	201452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387885943
3545	NC_017909	AT	3	6	201517	201522	50 %	50 %	0 %	0 %	387885943
3546	NC_017909	ATTTG	2	10	201525	201534	20 %	60 %	20 %	0 %	387885943
3547	NC_017909	ACTA	2	8	201599	201606	50 %	25 %	0 %	25 %	387885943
3548	NC_017909	TGA	2	6	201693	201698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387885944
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3550	NC_017909	TAA	2	6	201875	201880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387885944
3551	NC_017909	AACT	2	8	201903	201910	50 %	25 %	0 %	25 %	387885944
3552	NC_017909	TGAA	2	8	201944	201951	50 %	25 %	25 %	0 %	387885944
3553	NC_017909	CTGAGA	2	12	201986	201997	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	387885944
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3555	NC_017909	AGA	2	6	202077	202082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387885944
3556	NC_017909	AGA	2	6	202098	202103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387885944
3557	NC_017909	GAT	2	6	202128	202133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387885944
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3559	NC_017909	ATT	2	6	202188	202193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387885944
3560	NC_017909	TAA	2	6	202311	202316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387885945
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3564	NC_017909	TTG	2	6	202716	202721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387885945
3565	NC_017909	GATA	2	8	202726	202733	50 %	25 %	25 %	0 %	387885945
3566	NC_017909	AT	3	6	202755	202760	50 %	50 %	0 %	0 %	387885945
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3570	NC_017909	AAGGA	2	10	203008	203017	60 %	0 %	40 %	0 %	387885945
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3587	NC_017909	TAT	2	6	203806	203811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387885947
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3589	NC_017909	TATG	2	8	203860	203867	25 %	50 %	25 %	0 %	387885947
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3592	NC_017909	TGA	2	6	204138	204143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387885947
3593	NC_017909	CAAG	2	8	204176	204183	50 %	0 %	25 %	25 %	387885947
3594	NC_017909	TGT	2	6	204190	204195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387885947
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3602	NC_017909	TTGG	2	8	204399	204406	0 %	50 %	50 %	0 %	387885948
3603	NC_017909	GC	3	6	204418	204423	0 %	0 %	50 %	50 %	387885948
3604	NC_017909	AAGT	2	8	204438	204445	50 %	25 %	25 %	0 %	387885948
3605	NC_017909	T	6	6	204453	204458	0 %	100 %	0 %	0 %	387885948
3606	NC_017909	ATTG	2	8	204477	204484	25 %	50 %	25 %	0 %	387885948
3607	NC_017909	TTTA	2	8	204501	204508	25 %	75 %	0 %	0 %	387885948
3608	NC_017909	TGG	2	6	204526	204531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387885948
3609	NC_017909	TGA	2	6	204551	204556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387885948
3610	NC_017909	AG	3	6	204562	204567	50 %	0 %	50 %	0 %	387885948
3611	NC_017909	TTG	2	6	204569	204574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387885948
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3614	NC_017909	TTAA	2	8	204685	204692	50 %	50 %	0 %	0 %	387885948
3615	NC_017909	ATAA	2	8	204851	204858	75 %	25 %	0 %	0 %	387885948
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3620	NC_017909	TAC	2	6	205107	205112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387885949
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3988	NC_017909	TAC	2	6	222400	222405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387885980
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